相较于国外疫情剧烈,台湾武汉肺炎确诊数虽超过440例,但因台湾疫情控制得当,没有在国内造成大规模感染。阻断疫情的关键之一是台湾有一套完整的传染病监测机制,在平时监测风险,遇变时则成为采取行动的利器。所以,这次武汉肺炎爆发之初,台湾就能迅速反应,1月成立了中央流行疫情指挥中心,在资讯科技的协助下,根据数据进行防疫决策。
这套监测机制包括连接从基层诊所到医学中心的法定传染病通报系统,自动传送及登打传染病个案资料;在急诊方面,则有串连全国约180家医院急诊资料的“即时疫情监视及预警系统”(Real-time Outbreak and Disease Surveillance System,RODS),不需要人工填表,就能将全国急诊量95%以上的急诊诊断资料传送到疾管署,自动分析、产生报表,早一步监测疾病或症候群的异常情形;在门诊及住院部分,对整合了健保署的健保资料。
上述的监测机制主要由疾管署疫情中心负责,而当武汉肺炎出现确诊案例,相关人员展开疫情调查,搜集确诊者接触史、清查其活动纪录、厘清感染来源、接触者,对疑似感染者实施筛检、要求居家隔离等等,是及早防堵疫情扩散的有效做法。
目前台湾疫调时,一旦有确诊案例出现,第一时间由医院通报,再由疫调人员以制式的表格及问卷访谈,取得确诊案例过去旅游史、接触史等资讯,交给疾管署,再输入到数据库,经过BI数据分析后,找出确诊者间的关联性,设法厘清确诊者的关联性,和各县市卫生局或相关单位进行沟通,并以人工方式绘制图表,让中央流行疫情指挥中心对外公布。
用图谱化数据分析协助探索确诊者的关联性
然而,数据分析需要有经验的人员找出数据背后的关联性,随着确诊案例增加,要从大量疫调数据中挖掘数据中隐而不显的关系,已逐渐成为防疫人员的重担,后来,有一款知识图谱视觉化工具Gemini explore获得疾管署疫情中心的青睐,4月初即以公益性质来提供中心分析人员试用。
这款工具是精诚资讯投资的新创团队Gemini Data在去年推出的产品,原本主要用于资安及IT维运管理上。在今年初爆发武汉肺炎,台湾确诊案例不断增加,Gemini Data自行整合了来自媒体报导、指挥中心公开的确诊者资讯,改以知识图谱(Knowledge Graph)的方式呈现,借由探索资料的不同面向,试着找出确诊者的关联性,并且追踪和相关接触者的关系。
后来,精诚将一些确诊者关连性分析画面截图,提供给疫情中心后颇受好评,4月初,Gemini Data到疾管署安装这套系统,5月进一步根据意见更新,并参加了台美防疫松(cohack),以视觉化呈现确诊者、接触者关联性,最后入选为优胜作品之一。
Gemini Data共同创办人林宗瀛表示,过去放在数据库的资料,多半只进行BI分析,产出统计图表,不易判断数据间的关联,尚需仰赖资料分析人员的经验来比对。改以知识图谱的方式呈现数据,能够帮助疫调人员探索确诊者背后的关联性。
“知识图谱会是未来改变数据分析,相当有潜力的工具”,但技术门槛高,他说,过去多是跨国科技业者才会使用,“我们要将知识图谱工具化,让所有人未来都能使用”。
当要分析某个确诊个案时,利用图谱形式,来展开疫调时所取得的该名确诊者各项资讯,例如性别、居住地区、职业身份、曾在国外旅游或留学、症状等等,疫调人员可以根据不同的疫调资料,探索和其他确诊者间的关联性,例如找出同样自西班牙回到台湾,并且是留学生的确诊者,将符合两个条件的所有确诊案例设定为同一个感染事件的群组,进一步调查其感染关系。
过去,资料分析人员多用直接下数据库查询指令来进行关连比对,但这个作法不易发现复杂的数据关系,改透过图谱图像化的方式来呈现数据,让分析者自由探索,分析人员更容易判断、发掘数据中的关系,也更接近人类思维的方式。
林宗瀛指出,知识图谱界面提供了自助式操作,使用者不需要IT人员的协助,就能直接和不同的数据互动,找出其他可能的关联性,不只是确诊者的背景资料,结合接触者资料,进一步探索不同确诊者及接触者的关联。
例如可以从单一的确诊案例,像是从案例X的过去活动纪录及接触者疫调资料中,找到和另一位确诊案例Y的关系,从而可能判断出两个确诊案例间的接触感染关系。
尽管国内疫情目前已趋缓,这套工具未来也能套用在监测其他传染疾病疫情的发展追踪,而一般企业在数位转型的过程中,可运用知识图谱数据分析工具,例如电商业者强化对客户关系的经营。目前Gemini Explore主要功能是图谱资讯视觉化,林宗瀛更透露,明年会进一步加强AI判断能力。
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