
成大医院过年前即启动战情资讯看板,一手掌握台湾最新疫情动态、世界疫情、院内疫情摘要等,还有院内医护人员班表、急诊与ICU病床资讯,以及各单位物资统计。这些资讯,是成大防疫小组每日决策的重要参考。
成大医院
在1月23日小年夜这天,街道上熙熙攘攘,许多人早已离开工作岗位,回家准备过年。然而,在成功大学医学院附设医院(简称成大医院)中,仍有一群人聚集在会议室,盯着墙上的战情资讯看板,兢兢业业地讨论著。
他们,就是成大医院防疫团队的核心人物,以院长为指挥官,带领了副院长以及站在第一线的感染科主任、临床医师,还有在幕后以IT推动防疫工作的资讯长团队等数十人。这天,正是成大医院武汉肺炎战情资讯看板上线的第一天,也是卫福部成立中央流行疫情指挥中心成立后的第三天。
这个战情资讯看板,汇集了关键的疫情动态消息,也是成大医院每天早晨防疫会议的决策参考。资讯看板由六个大屏幕组成,首先是台湾的疫情现况,斗大的数字清楚显示确诊人数、通报个案等,还有台湾确诊个案的地理分布图,辅以卫福部的最新消息来补充。再来,则是世界疫情资讯与确诊统计图,可掌握各国动态,每分钟更新两次。
接着是成大医院院内的最新疫情摘要,包括院内通报个案、待检验人数、确诊个案、排除人数等关键讯息,另也附上院内排班表,可一眼掌握第一线医护人员的工作状态。
另一个屏幕,显示著成大医院院内急诊与加护病房(ICU)的病床资讯,以一张图表即时呈现每张病床的状态和病人状况,方便决策者调配资源。再来是院内的物资存量统计系统,涵盖口罩、护目镜、防护衣等资源,“特别是成大医院拥有5,000多名医护人员,后来口罩供不应求时,系统每天更新2、3次,来快速调配物资,”推动防疫关键IT应用的核心人物、成大医院资讯长蒋荣先说。
以战情资讯看板为核心,病历自动化改善检疫流程痛点
在过年前就启动的,不只是战情资讯看板这个核心系统,还有一系列的防疫计划。比如,成大团队在医院入口皆设置了红外线体温感测装置,用来确认入院人员是否发烧;团队也从无到有,在短时间内,快速搭建了急诊室外8个帐篷检疫站,要是入院民众耳温超过37.5度,或是有上呼吸道症状且本身或家人有中国旅游史,就会由专员带到临床检疫站,进一步处理。
作法1:搭建武汉肺炎临床检疫站
成大医院自农历年前,就启动一系列防疫计划,首先是在急诊室外搭建8个临床检疫帐篷,让耳温超过37.5度的民众,或是有上呼吸道症状且自身或家人具中国旅游史的民众,在此处进行检疫,以决定是否须进行病毒RNA筛检。
这些检疫站可说是医院第一道防线,在农历年初就正式运作了。虽然,团队在短时间内就推出检疫相关配套措施,但仍有改进空间。像是,检疫流程很花时间、人力,当民众进入检疫站,还须仰赖护理人员一问一答、人工填写检疫表格,再输入至电脑系统,才能建档,以便后续追踪。“这个作法,难免增加护理人员被感染的风险,”蒋荣先表示。
为解决这个痛点,团队也快速拍板,从检疫站的第一步改善。为提高效率,成大医院导入了几十套平板电脑,来取代原本需要手写的检疫表格,让进入检疫站的民众,可于平板电脑上,自行输入旅游史、职业史、接触史和群聚史等防疫必问的TOCC内容。资料填妥送出后,便直接汇入医院电子病历系统,医护人员就可即时查看。
作法2:采用平板达到病历自动化
为了降低交叉感染风险、提高资讯串接效率,成大医院将检疫站中,原本需要护理师一问一答、人工填写的检疫表单电子化,提供平板,由民众自行输入,之后再透过酒精来消毒。而填妥的资料,就会直接上传至医院电子病历系统,供医护人员即时查阅。
“如此作法,不只是病历自动化,也能降低护理人员交叉感染的风险。”蒋荣先指出,相较于纸笔,平板在每次使用后,就会以酒精消毒,减少感染风险。
以半年智慧医疗专案为基础,开启武汉肺炎X光片AI计划加速检疫
除了从硬件下手,成大医院也锁定胸腔X光片判读,要透过AI辅助、找出疑似武汉肺炎病症,来加速医师判读的时间。这项武汉肺炎AI专案,由蒋荣先与成大医院胸心血管放射线科主任蔡依珊来推动。他指出,原本的检疫流程是民众进入检疫站后,须拍摄胸腔X光片,再由医师判读、找出疑似武汉肺炎的病症,以决定是否要进行RNA病毒筛检。
不过,由于一人不只拍摄一张X光片,“如果检疫民众人数较多,医师就需花更多时间,来判读X光片。”这样一来,不只造成医师疲劳,民众也须长时间等待。而成大医院整套检疫流程跑下来,就要2个多小时。
因此,为提高检疫效率,成大医院团队决定自行开发武汉肺炎AI。专案团队整合了成大半年前组织的智慧医疗专案团队,包括成大资工所与成大医院影像医学部,以当时研发的自发性气胸AI预警系统为基础,来发展新AI判读模型。
这次,团队着手改良了史丹佛大学机器学习小组的CheXpert-1开源模型,并利用美国国家卫生研究院(NIH)释出的胸腔X光片资料集,取其中3,000张有无肺炎病症的影像,来进行模型预训练。
接着,团队再以成大医院标注的2,000笔资料,包括500笔具肺炎病症正样本,以及1,500笔无肺炎病症的负样本,来微调这套AI模型。最后,再利用医院最近收集的92笔疑似武汉肺炎(COVID-19)的胸腔X光片,来进行验证。
尝试失败找出症结,武汉肺炎X光AI工具成功上线
“很可惜,AI辨识效果始终不理想,”蒋荣先表示。对此,团队也与临床医师来回讨论,归纳出最有可能的原因,“就是开源资料集的影像品质参差不齐。”他解释,由于公有资料集的影像,来自不同等级的医院,而这些医院拍摄的影像目的不尽相同、影像品质也随之不同,标注水准良莠不齐,影响了AI模型的表现。
后来,团队进一步调整策略,来改善模型辨识能力。首先,团队采用深度学习中容错性较高的ResNeXt-1架构,来训练、调整AI模型。再来,在特征提取工程中,则加入了Squeeze-and-Excitation Network(SENet)网络架构,来让“模型更专注于重点资讯。”此外,团队也采用Feature Pyramid Network(FPN)网络,来增强模型的感知视野,强化模型对大小不一的病症辨识能力。
另一方面,由于武汉肺炎案例仍属少数,团队也遇到了训练资料正样本不足的问题。为此,团队以两个方法来解决,首先,由于正样本数量少、不易精准预测病症定界框(Bounding Box),于是,团队将原本的定界框预测任务,转换为影像语义分割(Segmentation)任务。
再来,团队采资料增强(Data Augmentation)方法,来增加训练资料,也就是随机将影像放大、缩小、左右旋转、水平翻转,或是倾斜、调整明暗对比;然后将影像随机裁切为320 x 320,并在每一次迭代中,随机进行影像调整。这个方法,可避免模型过度训练(Overfitting),也能增加稳健性(Robustness)。
调整过后,接着,团队再利用成大医院额外标注的1,245份胸腔X光片,包含553分正样本与692分负样本,来训练这套AI模型。
完成训练后,团队也以医院近期收集的122笔疑似武汉肺炎病症资料,来验证模型辨识能力。结果显示,AI模型对训练集和测试集的敏感度(Sensitivity),分别是91.4%与76.9%,特异度(Specificity)为92.5%、90.8%,准确率(Accuracy)则是92%与89.8%。这个表现,“与院内专业医师判断相当,”蒋荣先说。
这项武汉肺炎AI专案从2月初启动,短短两周就完成开发和测试,近期也正式进入第一线,作为检疫站临床医师的小帮手。蒋荣先表示,这套AI可在检疫民众拍摄胸腔X光片后,0.1秒内找出病症位置,并以热区图(Heatmap)标示病症之处,同时以颜色呈现罹武汉肺炎的概率,再由医生确认。
作法3:借助AI加速肺部X光片判读
为加速判读时间,成大医院团队开发一套武汉肺炎判读AI,可将X光片中疑似病症标示出来,并以颜色显示患病概率(大于0.5即为高风险),再由医师确认。本示意图显示,经AI判读,患武汉肺炎概率为0.28,非高风险族群。
有了它,整趟检疫流程从原本的2个小时,缩短为30分钟不到。不只大幅缩短检疫流程,“这套AI系统,还可辅助其他专科医生或资浅的医生,来判读胸腔X光片,”蒋荣先指出。
精益求精,还要导入迎宾机器人攻病历自动化2.0
至今,成大医院检疫流程已大幅精进,不过,团队仍继续思考改良之道,还要更上层楼;其中之一,就是目前评估要导入的迎宾机器人。蒋荣先指出,成大医院每日都在衡量疫情变化,“我们思考,要是未来疫情加剧,会在检疫站口导入国产Zenbo机器人,一方面迎宾,一方面辅助检疫民众在屏幕上输入TOCC资料。”
在他看来,相较于全副武装的医护人员,能歌能舞的迎宾机器人,不只能带给检疫患者亲切的第一印象,也能引导患者输入病历资料,或提供其他有帮助的检疫医疗资讯。反过来说,当疫情更加严峻时,迎宾机器人也能减少医护人员与检疫民众的接触,进而降低感染风险。
作法4:以Zenbo机器人达到病历自动化2.0(建置中)
目前,成大医院团队也正评估导入Zenbo机器人,作为检疫站中,兼具迎宾功能,也能让检疫民众填写旅游史、职业史、接触史和群聚史等资料,并串联医院电子病历系统。
不只如此,这套机器人,也是成大医院未来长照与居家照护的策略重心。两年前,成大成立科技部AI生技医疗创新研究中心,引进了Zenbo机器人,由蒋荣先与成大AI生医长照研发团队,来开发机器人背后的自然语言知识库与相关AI应用,目的是要将Zenbo打造为陪伴照护型机器人。
蒋荣先指出,机器人的目标是要协助医师,提醒长者用药资讯,并同时透过蓝牙穿戴装置,记录长者生活状况,像是血糖、饮食、运动等。除此之外,还要能陪长者聊天、读新闻,甚至要结合医疗云端平台,将机器人记录的数据上传,来进一步分析并提供给医护人员或营养师参考。
就现阶段而言,这款机器人已可做到聊天对话、读新闻、提供相关卫教资讯等,也可透过长者亲属或照护人设定,来自动计算用药提醒时间,让长者按时服药。目前,成大也已部署20多台机器人,于台南市社区及药局进行测试。与此同时,团队也正研发一套影像辨识AI模型,要来分析长者的脸部表情,进一步了解被照护者的情绪。如此一来,机器人就能根据长者的情绪,来进行不同的问候。
除了在硬件上下功夫,医疗影像AI也是成大医院着墨的另一大领域。蒋荣先指出,成大医院一年所产生的医疗影像,就超过3,400万张,其中有X光片、电脑断层扫描、心电图、核磁共振影像、超音波影像等。在他看来,如此庞大的资料量,是AI在医疗影像领域上发光发热的最佳条件;透过精准的医疗影像判读AI,可减少放射科医师判读大量影像的负担。
近几年,成大与成大医院团队联手,纷纷于肿瘤科、心脏科、放射科、重症医学科、妇产科、肠胃消化科和急诊科等科别,导入实验性的AI计划。其中一项,便是蔡依珊主导的非典型缺血性心肌梗塞AI,可在心脏主动脉电脑断层扫描(CT)影像中,透过AI告诉医师,在一份医疗影像中,不是只有一个故事;也就是除了判断主动脉剥离之外,还可以确认病人是否患有非典型缺血性心肌梗塞。就初步成果来看,模型准确率达84%,且与院内表现最好的医师相比,只相差4%。未来,成大团队还要开发更多医疗影像AI,作为医生辅助诊断的有力工具。文⊙王若朴
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