
高雄荣总以国际新一代医疗资料交换标准FHIR和个人健康记录概念,打造一款医疗资讯万事通App,让民众一手掌握88项生理指标和健康风险指数。(图片来源/高雄荣总)
“高荣要用FHIR打下云端原生EMR的基础!”高雄荣总研创中心创新长暨放射线部专任主治医生杨宗龙说道。他,就是高雄荣总数位发展的关键推手,早在两年前将全院152支HIS系统全数网页化,现在更逐步将这些系统上云,未来还要往云端原生(Cloud-native)迈进。在他眼中,新一代国际医疗资料交换标准FHIR,正是未来云端原生电子病历(EMR)系统的必要关键。
高雄荣总医疗数字化发展,可从医院初创时期说起。1990年高雄荣总成立,即以大型主机来发展医疗资讯系统(HIS)架构,第一代医疗影像储传系统(PACS)也采主从式服务器架构。
2006年,杨宗龙看准网页化(Web-based)趋势,先将院内PACS全面网页化,让临床医生可直接在网页上检视医疗影像。这个阶段,正是高雄荣总2.0。
接着,2018年,杨宗龙继续扩大网页化工程,将原本建置于大型主机的系统也全数网页化,让全院152支系统都能支援网页式电子病历,这就是高雄荣总3.0时期。自此之后,杨宗龙马也不停蹄地推动云端优先(Cloud-first)策略,正逐步将各种EMR相关系统上云,来实现高雄荣总4.0。
不过,“从网页化系统走向云端,就必须考虑公私云间的资源分配,以及资料交换作业。”杨宗龙指出,为方便日后于云端交换医疗资料和后续资料分析,他选择FHIR,决定以它作为资料互通标准,替接下来的云端原生EMR打基础,也就是2025年即将展开的高雄荣总5.0云端原生计划。
看上FHIR三大优势:弹性高、行动化和工具多
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高雄荣总研创中心创新长杨宗龙指出,医院资讯系统云端化时,得考虑资料交换和公私云资源配置,而FHIR就是其中关键。(摄影/洪政伟) |
FHIR究竟有什么本事,让杨宗龙视为医院下一步转型的关键?
首先,FHIR弹性高。杨宗龙解释,比起台湾现行采用的资料交换标准CDA R2,FHIR可支援临床和非临床类型的资料,像是财务、行政、研究等资料,甚至是数位病理、基因工程和医疗影像的AI标注。而且,FHIR支援的档案格式不只XML,还包括其他医疗作业常用的格式如JSON、Turtle等。
第二,FHIR紧跟医疗行动化趋势。FHIR在互通架构上,不仅遵从国际电子病历交换作业标准IHE XDS,还支援了国际行动装置健康资料交换架构IHE MHD,因此,可让医疗资料在行动装置或资源受限的系统上存取,像是手机、平板、Kiosk事务机或医疗仪器等。此外,FHIR还采用行动App常用的RESTful API来传送资料,杨宗龙认为,这与行动化技术一致性高。
他的第三个原因是,FHIR已有许多开源工具和加值应用资源,像是开源的FHIR数据库服务器软件HAPI FHIR,或是医疗平台SMART发展出的FHIR应用程序市集SMART App Gallery,不只目前规模最大,上面还提供各种App,如健康风险预测、疾病管理、资料视觉化等类型供医院采用。
杨宗龙强调,SMART也提供了一套App开发框架SMART on FHIR API,使用这套前端API框架,程式码只要写一次,就能在不同地方使用,比如App、HIS网页等。
正因为这些优势,2017年,杨宗龙与高雄荣总资讯室,找来专攻FHIR的医资厂商硅塔资讯,先在院内建置FHIR执行环境与基础架构。例如,高荣采用不少国外医院都采用的HAPI FHIR来建置FHIR服务器,并设计一套转档工具,将高雄荣总院内数据库的标准化病人资料,转换为FHIR格式,以便汇入到FHIR数据库。同时,高雄荣总也导入主流容器技术Docker,来提高现有主机资源的利用率。
有了这些基础建设,高荣也陆续导入结构化医疗资料和各种资料探勘工具,以及一系列FHIR相关应用,在这之中,他们挑出FHIR最热门的个人健康记录(PHR)应用,来作为第一个概念验证应用。
以LOINC和FHIR标准化资料,打造个人健康记录App验证可行性
于是,高荣希望透过FHIR串接各种医院资料,让民众透过单一App,就能掌握自己所有的医疗记录,像是生理量测数值、就医记录、检查检验,以及健康风险分析等。杨宗龙将高荣打造的这款个人健康记录App,命名为医疗资讯万事通。
由于高荣病人病历资料和检验资料仍储存在现有HIS中,于是,为了尽量不更动现有程式,高雄荣总资讯室透过RESTful API,将院内资料串接到FHIR转换工具,透过排程工具,定期撷取资料、转换为FHIR档案,同步写入院内FHIR服务器中。
打通App的资料串接流程只是第一步,为了利用这些资料来计算个人化的健康风险指数,高荣团找来医疗数据分析厂商,将原生FHIR格式资料去识别化之后,传送至厂商的健康风险分析AI模型,来计算风险,再将结果视觉化后整合至App中,供用户检视。
这款App串接了88个生理指标的资讯,包含常规检查、凝血功能、血液、血糖、血脂、癌症、酵素、肥胖因子、发炎因子、离子、肝功能、肺功能、心跳血压、肾功能、粪便检查、甲状腺功能、尿液检查等不同类别的数据,每个类别又各自包含不同指标。
在这当中,团队也遇到不少挑战。硅塔资讯首席执行官杨宇凡指出,为了让风险指数AI模型更准确,得用大量资料来训练,但各医院的HIS格式、疾病院内码和医令码等编码系统都不一样,“特别是生理量测指标,同样的检验项目,会因检验设备和方法不同,而产生不同的检验码,甚至连单位都不一样,”他说。
为解决这个问题,开发团队决定将这88个生理指标编码标准化。高雄荣总资讯室找来病检部与厂商共同讨论,决定采用国际检验资讯交换标准LOINC,来搭配FHIR资料结构,将原本的资料换为采用这两种标准的结构化资料。
如此一来,不仅利于模型训练和分析,再加上FHIR、LOINC都是国际通用标准,未来与其他医疗机构或保险业者进行资料交换时,就能有效互通。目前,他们也完成了横跨高雄荣总、台中荣总、台北荣总所用到206项生理指标的LOINC编码标准化工程。
而现阶段,这款App正进行最后的资安验证,“很快就能上线了。”杨宗龙强调,这款App不只是概念性验证,最后还会整合到实体就医流程,结合更多资料,要来提供更好的医疗照护服务给民众,甚至对医院来说,也能降低医疗成本。
高雄荣总资讯室和病检部联手FHIR厂商,开发出一套个人健康记录(PHR)应用程序:医疗资讯万事通App,可让民众透过单一App,掌握所有就医记录。图片来源/硅塔资讯
另一方面,医疗万事通App还介接健康风险预测AI模型,可根据民众的医疗资料和88项生理指标,计算出多种慢性病风险,供民众参考。图片来源/硅塔资讯
再接再厉,今年打造云端原生FHIR数位病理平台
有了FHIR App的尝试经验,今年,高雄荣总转而瞄准肿瘤病理资料。在FHIR标准中,衍生出一个利用FHIR格式实作的癌症资料结构化格式mCODE(Minimal Common Oncology Data Elements),可以用来描述肿瘤的各种电子健康记录(EHR),内容涵盖数位病理、病人基本资料、影像标记、生理量测、处方用药和基因资料等。mCODE的设计目标是,建立这类肿瘤资料的互通,来找出最合适每位病人的癌症治疗方法。
高荣计划先从mCODE中的数位病理模组下手,以3年时间来打造在云端原生的数位病理平台,作为高雄荣总迈向5.0阶段的第一步。为此,高雄荣总找来纬创医学,自今年3月开始打造平台,负责开发的纬创资通价值创新中心专案负责人许骏鹏指出,团队首先锁定肝癌和头颈癌,将工作分为影像和病理报告两部分来进行。
就影像来说,团队先将高雄荣总院内的肝脏、头颈部组织玻片扫描、数字化,并将资料格式转换为国际资料标准DICOM,储存至PACS数据库中。
这次病理报告数字化作业,是高雄荣总mCODE数位病理平台专案的第一步,不只要将旧有报告标准化、编码化,专案团队还根据病理医生报告内容,设计一套标准界面,将原本医生自由输入的报告说明(Free text)转换为勾选式表单,让医生以勾选方式来注记病理切片特征,利于后续资料分析。此外,这个平台也串接了AI辨识模型,可从数位病理影像中标示出疑似病灶,缩短医生检验时间。
在资料整合上,开发了32支API来串接医院EMR系统与新的mCODE数位病理平台,以进行EMR资料抛转。未来,杨宗龙希望,能以一支FHIR接收程式,就能打通数位病理平台至EMR的资料流,“让资料双向流通。”
不过,许骏鹏坦言,资料迁移工程是开发过程中的一大挑战。由于新完成的mCODE数位病理平台,不会马上取代原本旧有的HIS,因此,“得将旧系统长年累积的资料,抛转到FHIR格式数据库,不仅字段要对齐,工作流程也要能串连,”他说。
而明年,高荣要将资料流进一步整合相关的硬件设备(比如扫描机、条码输入机等),来完善“一个玻片的旅行史,”也就是从玻片进入病检部刷条码开始,经过扫描机扫描、扫描资讯进入系统,再由医生诊断、打报告、存档等,最后透过三位病理医生处理报告,包括初审、复审和决审等流程。“下一年的目标,就是要将资料流程与病理工作流程串接起来,”许骏鹏说。
今年,高雄荣总进一步联手纬创医学,利用FHIR mCODE概念打造一套数位病理平台,利用32支API串接院内EMR系统、汇整资料,同时也将原有的病理报告标准化,打下后续分析基础。图片来源/高雄荣总
为保持FHIR数位病理平台的运作,并同时确保新旧病理数据库的工作不中断,高雄荣总与纬创资通除了以API来介接报告资料至新旧数据库,还得一一将旧系统资料对应到FHIR数据库中。图片来源/纬创资通
下一步联手台北荣总,要建立跨院数位病理环境
有了新的院内数位病理平台之后,高雄荣总下一步,就是要以FHIR mCODE平台,与台北荣总病检部建置一个跨院数位病理环境,先从两家总院的远距数位病理联测开始着手。
杨宗龙表示,由于台北荣总数位病理仪器与高雄荣总不同,因此为确保资料格式的一致性,需要藉联测来了解互通程度。届时,他们计划请筹办过台湾首届FHIR联测的台湾医疗影像资讯标准协会(MISAT)做为第三方裁判,来评估双方资料转换的能力。
之后,“我们还要把其他荣总分院也纳入,一起进行远距数位病理联测。”杨宗龙的最终目标,是要参加国际联测,来证明数位病理平台符合国际标准,并申请美国食品药物管理局(FDA)认证,将技术商品化。“希望能将高雄荣总和台北荣总的病检部,从成本中心变成利润中心,”他说。
不只如此,杨宗龙还有更远大的目标,希望借着打造这套云端原生数位病理平台的经验,来推动高雄荣总发展更多云端原生EMR系统。他认为,在这个基础上,就能以FHIR串接更多医疗资讯系统,而且也能进一步扩大到医疗以外的领域,像是医政、法政、户政,打造出真正的智慧照护城市。
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