谷歌AI设计蛋白质 提速8.6倍剑指抗癌
报价宝综合消息谷歌AI设计蛋白质 提速8.6倍剑指抗癌
谷歌研究人员近日公布了三项把AI代理引入生物学实验的项目成果。其中一项通过名为“手术式表位切除”（surgical epitope excision）的新技术，把蛋白质结构预测的速度提升8.6倍，且在测试中没有牺牲结构精度。
设计能附着在特定生物靶点上的蛋白质，需要预测分子如何折叠与相互作用。最耗算力的一步是验证候选分子与靶点的结合情况，靶点蛋白越大越是如此。新方法的思路，是把结构预测聚焦在结合位点附近的局部区域，而不是处理整个靶点。
团队用该方法瞄准了与实体瘤相关的分子FAP，先在计算中设计出一系列能与之紧密结合的蛋白质，再通过酵母表面展示和流式细胞分选技术在实验室里筛选，最强设计达到了个位数纳摩尔的结合亲和力，说明分子结合相当紧密。谷歌强调，这些蛋白质黏合剂尚未被证明可以安全有效地用于癌症治疗。
另一个项目测试AI代理能否改进DNA适配体。团队针对肌红蛋白和凝血酶开展了三轮设计、合成与测试循环，每轮约7到10天，第三轮确认的命中率分别达到33.5％和42.1％，其中凝血酶实验的特异性达到98.5％。
第三个项目是一个实验执行平台，让AI代理掌握设备清单、液体体积和实验材料等信息，在向实验室机器人下达指令前先模拟流程并发现潜在错误。
谷歌表示，在计算资源相同的对比实验中，一名与AI代理协作的科学家取得的预测命中率接近单打独斗者的两倍。研究仍处于早期分子设计阶段，距离临床应用尚远。
编译自 Interesting Engineering，原标题：“Google speeds protein structure prediction 8.6-fold to advance targeted cancer research”
