图片来源/国网中心官网
继今年7月起提供台湾AI云(Taiwan Computing Cloud,TWCC)服务之后,国研院国网中心为了降低生医领域跨足AI应用的门槛,也着手整合了各类生医数据库与过去开发的软件技术,结合TWCC的运算资源推出“智慧医疗建模平台”,预计在12月开放学研单位、产业界申请使用。
智慧医疗建模平台整合了多项服务,其中在软件技术的部分,整合了国网中心过去与各大医院、学校合作的研究成果,包括与长庚医院合作开发的睡眠呼吸中止症评估平台、与台大兽医系合作的数位病理标记与分享系统,其他还有如骨材与医材构型设计评估平台、MiiL影像标记软件与VVViewer虚拟实境互动显示软件、三维脑神经影像数据库与神经元切分技术,以及基因体与蛋白质分析平台等。
在数据库整合的方面,国网中心运用数据共享平台(Data Commons)的概念,建置国网生科云LIONS,串接各类生医研究常用数据库的API,提供单一入口平台,让研究人员可以同时查询多种数据库。使用者运用资料时可以自定存储权限,也能够过人体透视图更直觉化的操作界面,直接点选人体器官或组织来筛选资料集等。
LIONS除了提供生医研究常用数据库如TCGA肿瘤数据库、Ensembl基因数据库、Ref. Genome数据库之外,近来也正在导入台湾人体生物数据库与微生物相数据库。国网中心应用开发服务组组长王聿泰表示,台湾人体生物数据库是-的重大投资,预计要搜集30万个检体,其中20万个为正常人的基因,10万为遗传性疾病基因,来建立特定基因与遗传疾病的关联性。
此外,由于智慧医疗建模平台建立于AI超级电脑“台湾杉一号”的云服务上,使用者也能直接运用LIONS的数据库来建模、执行AI运算,再下载模型、透过网页或App来提供服务;而国网中心也会提供常用、基础的模型给使用者勾选,并协助训练模型、调整参数达到最佳化,目标要让使用者一键自动键模,且能定期更新核心AI引擎。
在所有AI的应用中,王聿泰也特别提到次世代基因定序的服务。由于一个人的全部基因体资料量就有200G,在执行运算更会占用大约700G的暂存内存,但市面上少有能执行如此庞大运算的硬件资源,因此,国网中心也特别提供基因定序分析软件、AI云的大内存以及平行运算设备、用于储存与传输大型档案的高速平行化档案系统、还有保存定序资料的异地备份设施。要透过软硬件资源缩短定序时间,让研究者更容易执行研究。
王聿泰表示,国网中心过去主要扮演研发中心的角色,与各单位合作发展尖端技术,待技术成熟后再进行技转;不过随着政策转变,已经逐渐从研发者转为辅助的角色,除了提供硬件运算资源来加快研究的进程,更重要的是投入技术专家来提供客制化的服务,降低生医研究员要跨足AI应用的门槛。
也因此,研究单位申请向国网中心申请服务后,国网中心的技术专家会介入协助使用者建模、开发系统,提供再由用户端的IT人员来接手维运。“我们要点一把火烧起各产业在AI上的应用热潮,产学研各单位有任何想法,都可以先用TWCC的资源来试验,成功后再投入经费来开发,让AI应用落地。”王聿泰表示。
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